DyNAlgue (2017-2021)
Dans le contexte de l’augmentation de la population humaine, le développement de la culture des microalgues offre de nombreux avantages. Elle ne rentre pas en concurrence avec l’utilisation des terres agricoles et présente des productivités très élevées (en moyenne, la biomasse double chaque jour). Cependant, l’exploitation des microalgues est très récente, tout comme la mise en place des programmes d’amélioration.
Depuis sept ans, le laboratoire travaille sur ces aspects d’amélioration chez les microalgues dont les verrous majeurs sont, à l’heure actuelle, les coûts et les capacités limitées des méthodes de phénotypage.
La sélection assistée par marqueurs moléculaires est la solution mise en œuvre dans tous les programmes d’amélioration réalisés sur les espèces agronomiques majeures pour résoudre cette contrainte de phénotypage. Elle nécessite cependant l’identification des marqueurs moléculaires liés à une variation phénotypique. Aujourd'hui, la meilleure des stratégies établies pour cette identification est la génétique d’association. Nous proposons de développer la première approche de génétique d’association chez les microalgues qui permettra de décrire les bases génétiques de traits complexes chez les algues et d’établir les premiers marqueurs moléculaires pour de futurs programmes d’amélioration.
Dans ce projet, les bases génétiques, qui jouent un rôle dans la variation de composés lipidiques ou pigmentaires, seront pour la première fois décrites chez les algues. Une attention particulière sera portée sur des molécules antioxydantes comme les omega-3 et les caroténoïdes qui ont un rôle important dans la nutrition humaine.
Le projet DynAlgue est donc le point de départ pour de futurs programmes de sélection assistées par marqueurs moléculaires chez les microalgues et permettra ainsi de réduire le fossé existant avec les espèces agronomiques d’intérêt.
Approches réalisées :
- Caractérisation de la diversité inter et intra-souche de l’espèce. Comparaison phénotypique (cytomètre imageur) et génomique (séquençage pan-génomique des souches).
- Construction d’une collection de clones. Phénotypage et génotypage haut débit de la collection.
- Détection des polymorphismes génétiques et test de génétique d’association.
